Graph-based prediction of Protein-protein interactions with attributed signed graph embedding

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Disease Protein Prediction with Graph Convolutional Networks

Human phenotypes – i.e. our characteristics, conditions and diseases – are not merely a product of our genetic constitution, but rather arise out of an intricate system of interactions between the proteins and other molecules in our cells. 1 This fact has inspired a huge effort to document and understand the network of those protein-protein interactions which we’ll refer to collectively as the ...

متن کامل

dynamic coloring of graph

در این پایان نامه رنگ آمیزی دینامیکی یک گراف را بیان و مطالعه می کنیم. یک –kرنگ آمیزی سره ی رأسی گراف g را رنگ آمیزی دینامیکی می نامند اگر در همسایه های هر رأس v?v(g) با درجه ی حداقل 2، حداقل 2 رنگ متفاوت ظاهر شوند. کوچکترین عدد صحیح k، به طوری که g دارای –kرنگ آمیزی دینامیکی باشد را عدد رنگی دینامیکی g می نامند و آنرا با نماد ?_2 (g) نمایش می دهند. مونت گمری حدس زده است که تمام گراف های منتظم ...

15 صفحه اول

The H - Line Signed Graph of a Signed Graph

A Smarandachely k-signed graph (Smarandachely k-marked graph) is an ordered pair S = (G,σ) (S = (G,μ)) where G = (V, E) is a graph called underlying graph of S and σ : E → (e1, e2, ..., ek) (μ : V → (e1, e2, ..., ek)) is a function, where each ei ∈ {+,−}. Particularly, a Smarandachely 2-signed graph or Smarandachely 2-marked graph is called abbreviated a signed graph or a marked graph. Given a ...

متن کامل

A Structured Learning Approach to Attributed Graph Embedding

In this paper, we describe the use of concepts from structural and statistical pattern recognition for recovering a mapping which can be viewed as an operator on the graph attribute-set. This mapping can be used to embed graphs into spaces where tasks such as categorisation and relational matching can be effected. We depart from concepts in graph theory to introduce mappings as operators over g...

متن کامل

Protein function prediction via graph kernels

MOTIVATION Computational approaches to protein function prediction infer protein function by finding proteins with similar sequence, structure, surface clefts, chemical properties, amino acid motifs, interaction partners or phylogenetic profiles. We present a new approach that combines sequential, structural and chemical information into one graph model of proteins. We predict functional class ...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: BMC Bioinformatics

سال: 2020

ISSN: 1471-2105

DOI: 10.1186/s12859-020-03646-8